Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms