Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms