Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms