Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gabpb1Q00420 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms