Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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