Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TgfbiP82198 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms