Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nucb2P81117 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nucb2P81117 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nucb2P81117 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nucb2P81117 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nucb2P81117 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nucb2P81117 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nucb2P81117 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nucb2P81117 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nucb2P81117 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nucb2P81117 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nucb2P81117 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nucb2P81117 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms