Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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