Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ptprn2P80560 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ptprn2P80560 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ptprn2P80560 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptprn2P80560 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ptprn2P80560 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ptprn2P80560 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ptprn2P80560 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ptprn2P80560 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptprn2P80560 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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