Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms