Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rps11P62281 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rps11P62281 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms