Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ube2d3P61079 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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