Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms