Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp1P59054 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms