Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms