Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gsc2P56916 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gsc2P56916 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gsc2P56916 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gsc2P56916 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsc2P56916 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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