Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms