Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Mmp9P41245 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Mmp9P41245 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Mmp9P41245 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Mmp9P41245 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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