Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtbP41155 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LtbP41155 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LtbP41155 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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