Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VhlP40338 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VhlP40338 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VhlP40338 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VhlP40338 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VhlP40338 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
VhlP40338 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VhlP40338 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms