Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grin1P35438 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms