Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rom1P32958 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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