Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc10P31257 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc10P31257 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms