Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxraP28700 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxraP28700 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxraP28700 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxraP28700 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxraP28700 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxraP28700 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxraP28700 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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