Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms