Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Fcer1aP20489 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Fcer1aP20489 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Fcer1aP20489 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Fcer1aP20489 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Fcer1aP20489 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Fcer1aP20489 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Fcer1aP20489 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Fcer1aP20489 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Fcer1aP20489 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Fcer1aP20489 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Fcer1aP20489 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Fcer1aP20489 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Fcer1aP20489 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Fcer1aP20489 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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