Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VimP20152 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VimP20152 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VimP20152 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VimP20152 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VimP20152 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VimP20152 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VimP20152 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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