Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P20040 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P20040 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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