Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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