Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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