Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms