Protein–RNA interactions for Protein: P0C0A3

Chmp6, Charged multivesicular body protein 6, mousemouse

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp6P0C0A3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp6P0C0A3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp6P0C0A3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp6P0C0A3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp6P0C0A3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp6P0C0A3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp6P0C0A3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp6P0C0A3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp6P0C0A3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp6P0C0A3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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