Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BlmO88700 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BlmO88700 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BlmO88700 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms