Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp4O70480 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms