Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ldb2O55203 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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