Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms