Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlkO54988 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlkO54988 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlkO54988 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlkO54988 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlkO54988 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlkO54988 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlkO54988 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlkO54988 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlkO54988 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlkO54988 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlkO54988 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms