Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smarce1O54941 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smarce1O54941 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smarce1O54941 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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