Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TsksO54887 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TsksO54887 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TsksO54887 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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