Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FxnO35943 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FxnO35943 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FxnO35943 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FxnO35943 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FxnO35943 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FxnO35943 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FxnO35943 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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FxnO35943 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FxnO35943 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FxnO35943 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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FxnO35943 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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FxnO35943 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FxnO35943 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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FxnO35943 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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FxnO35943 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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FxnO35943 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FxnO35943 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FxnO35943 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FxnO35943 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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FxnO35943 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FxnO35943 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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FxnO35943 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FxnO35943 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FxnO35943 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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FxnO35943 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FxnO35943 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FxnO35943 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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