Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Atf6bO35451 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Atf6bO35451 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Atf6bO35451 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Atf6bO35451 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atf6bO35451 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atf6bO35451 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atf6bO35451 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atf6bO35451 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atf6bO35451 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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