Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kpna4O35343 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kpna4O35343 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms