Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LhbO09108 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LhbO09108 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LhbO09108 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms