Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms