Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms