Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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