Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl4M0QW46 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms