Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms