Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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