Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc180J3QNE4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms